Státní tajná policie (gestapo) a kriminálni policie (kripo) zavírají především politické odpůrce nacistického režimu a ty, kteří neodpovídají rasistickým představám o nacionálněsocialistické »národní pospolitosti«. Kromě nich do Flossenbürgu deportuje wehrmacht nejméně 6.000 sovětských válečných zajatců.
Výkladová tabulka k označení vězňů koncentračního tábora Dachau (Arolsen Archives)
Lidé zadržení v rámci »policejní prevence« do Flossenbürgu přicházejí jako »profesionální zločinci« a musejí nosit zelený trojúhelník. Vězně z jiných okrajových skupin společnosti jako nezaměstnané a bezdomovce, žebráky či prostitutky, ale i Sinti a Romy označují příslušníci SS coby »asociály« černým trojúhelníkem. Přes 4.000 německých a zahraničních odpůrců režimu dostane červený »politický« trojúhelník.
Obrovskou část internovaných tvoří zahraniční nuceně nasazení muži i ženy, především z východní Evropy. I oni nosí červený trojúhelník. Písmeno na červeném trojúhelníku značí jejich národnost, Židé mají navíc ještě žlutý trojúhelník. Barva trojúhelníku i písmeno na něm rozhodují o tom, jaké postavení vězně v táboře čeká.